ในช่วงพัฒนาการของสมอง ช่วงเวลาของทารกในครรภ์มีความสำคัญในการสร้างเซลล์ประสาทจากเซลล์ต้นกำเนิดประสาทเพื่อสร้างสมองผู้ใหญ่ที่ใช้งานได้ ความบกพร่องใดๆ ในโปรแกรมพัฒนาการอาจส่งผลให้เกิดความบกพร่องอย่างรุนแรงในสมอง โรคทางพันธุกรรมที่มีลักษณะเฉพาะของความพิการทางสติปัญญาและอาการออทิสติก

ผู้ป่วย FSX มีความบกพร่องในยีน X ปัญญาอ่อน 1 ที่เปราะบาง ซึ่งเป็นยีนที่เข้ารหัสโปรตีนปัญญาอ่อน X ที่เปราะบาง ซึ่งเป็นปัจจัยสำคัญในการพัฒนาสมองตามปกติ กลไกระดับโมเลกุลที่เป็นไปได้ที่ทำให้เกิด FXS ในสมองของทารกในครรภ์ และทำให้เราเข้าใจมากขึ้นเกี่ยวกับความผิดปกติทางพัฒนาการทางพันธุกรรมในระยะพัฒนาการของสมอง การระบุโมเลกุลที่ควบคุมโดย FMRP หลายร้อยตัวในสมองของทารกในครรภ์ของหนู โมเลกุลเหล่านี้ไม่เพียงเกี่ยวข้องกับการสร้างเซลล์ประสาทเท่านั้น แต่ยังรวมถึงออทิสติกและความพิการทางสติปัญญาด้วย